Debiutował filmem Oto twoje życie (1966, Guldbagge - Złoty Żuk, przyznawany corocznie przez Szwedzki Instytut Filmowy). Na swoich doświadczeniach nauczycielskich oparł swój film Na kogo wypadnie (Złoty Niedźwiedź na MFF Berlin). Dzięki dwuczęściowej sadze filmowej Emigranci i Osadnicy, zrealizowanej na podstawie V. Moberga został uznany za kontynuatora najlepszych tradycji epickich kina szwedzkiego. W Berlinie został również wyróżniony Srebrnym Niedźwiedziem za Il Capitano. Troell uchodzi za wzór autora filmowego, ponieważ nie tylko reżyseruje i pisze scenariusze do swoich filmów, lecz także jest ich operatorem i montażystą.
Gdyby tylko jeden mój film miał mnie przeżyć, to chciałbym, aby to była "Baśniowa kraina". To mój najważniejszy film, najbliższy mi. [...] "Baśniowa kraina" naprawdę pochodzi z wewnątrz w wyższym stopniu niż którykolwiek z moich filmów.
(Tadeusz Szczepański, Jan Troell: opowieści o szwedzkim losie, Autorzy Kina Europejskiego IV, s. 241 na podstawie Gunnar Bergdahl, Uppehåll i Smygehuk. Jan Troell om sina filmer, Filmkonst 2001, nr 70, s. 34)
Filmografia:
1960 Miasto / Stad
1961 Letni pociąg / Sommartåg
1962 Statek / Båten
1963 Johan Ekberg
1964 Stary młyn / Den gamla kvarnen
1965 Portret Asy / Porträtt av Åsa
1965 Przystanek na bagniskach / Uppehåll i myrlandet / A Stopover in the Marshland (w: 4 x 4)
1966 Oto twoje życie / Här har du ditt liv / Here's Your Life
1968 Wyliczanka / Ole dole doff / Who Saw Him Die?
1971 Emigranci / Utvandrarna / The Emigrants
1972 Osadnicy / Nybyggarna / The New Land
1974 Narzeczona Zandy'ego / Zandy's Bride
1982 Napowietrzna podróż inżyniera Andrée / Ingenjör Andrées luftfärd / The Flight of the Eagle
1988 Baśniowa kraina / Sagolandet / Land of Dreams
1991 Il Capitano
1994 Dansen / Dancing
1997 En frusen dröm / Their Frozen Dream
1996 Hamsun
2000 92,8 MHz - marzenia z południa / 92,8 MHz - drömmar i söder
2001 Biały jak śnieg / Så vit som en snö / As White as in Snow
2003 Obecność / Närvarande / Presence
2001 Reflexion
2004 Yellow Tag (z: Wizje Europy) / Yellow Tag (from: Visions of Europe)
2006 Snigeln / The Snail
2008 Uwiecznione chwile Marii Larsson / Maria Larssons eviga ögonblick / Maria Larsson's Everlasting Moment